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La filtración por membrana en microbiología es un método alternativo para demostrar o estimar la presencia y cantidad de los mismos
microorganismos, tal cual se mide, usando el método de referencia correspondiente, para una determinada categoría de productos. La muestra se pasa a través de un filtro de membrana de 0.45 micras, ésta se coloca sobre la placa con agar, es incubada y se calculan los resultados. Este método es recomendado en aplicaciones con volúmenes grandes de muestras líquidas (agua, bebidas, alimentos líquidos o soluciones diluidas) o con bajo número de microorganismos. Este método aumenta la exactitud del análisis cuantitativo, libera lotes rápidamente, ahorro en trabajo manual y costo por análisis.